Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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