Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn7l3bQ3UD01 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms