Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud5Q3U2S4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud5Q3U2S4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms