Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec24aQ3U2P1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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