Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms