Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U1D9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U1D9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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