Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms