Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
InipQ3TXT3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
InipQ3TXT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms