Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms