Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms