Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd4Q3TT99 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms