Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms