Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms