Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms