Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fubp3Q3TIX6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms