Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2f1Q3THK3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms