Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam107bQ3TGF2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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