Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ap5b1Q3TAP4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms