Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa26Q3L180 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms