Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms