Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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