Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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