Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc162pQ0VG85 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms