Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col19a1Q0VF58 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms