Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms