Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms