Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
StumQ0VBF8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
StumQ0VBF8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms