Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem52bQ0VBF2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem52bQ0VBF2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem52bQ0VBF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem52bQ0VBF2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem52bQ0VBF2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms