Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms