Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cntnap5bQ0V8T8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms