Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms