Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms