Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms