Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms