Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms