Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms