Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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