Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms