Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnd1Q03719 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms