Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms