Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms