Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb5Q02739 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms