Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp39Q02525 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms