Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms