Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme2Q01768 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms