Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms