Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms