Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrcdQ00LT2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms