Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serpina1cQ00896 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms