Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms